В 1943 р. у сімнадцять років пішов на фронт, пройшов Велику Вітчизняну війну, у травні 1945 року дійшовши до Берліну. Вищу медичну освіту отримав у Дніпропетровському медичному інституті, який закінчив у 1959 році за спеціальністю «лікувальна справа».
В Дніпропетровському обласному наркологічному диспансері на посаді лікаря-нарколога В.П. Костюченко працював з 1978 року.
За двадцять років роботи лікарем-наркологом Василь Полікарпович зарекомендував себе як професіонал найвищого рівня, відповідальний та знаючий фахівець, чутлива людина. У професійній сфері В.П. Костюченко постійно розвивався, самовдосконалювався. Передавав свій досвід молодим лікарям, був справжнім наставником та прикладом для юного покоління.
Пішов із життя Василь Полікарпович у 2009 році.